微卫星标记(Microsatellite)也称为短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR) ,是广泛分布在真核生物基因组中的简单重复序列 ,一般由一个长2~6bp的核心序列经多次串联重复排列而成 ,重复次数大多在10~60次之间 。近年来 ,大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一 ,STR分型高效快捷 ,结果精确 ,是非常重要的遗传标记 ,在基因定位 、遗传育种等领域有着广泛的应用 。STR基因分型应用于细胞鉴定已被ATCC等机构强烈推荐 。美国的ATCC 细胞库 、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR 分型提供了各细胞株的数据供比对 。
微卫星位点通常通过PCR扩增和电泳检测 ,并根据片段大小分离等位基因进行分析;扩增后的等位微卫星可以用多种方法检测 ,传统方法采用聚丙烯酰胺凝胶电泳加放射显影或银染的方法 ,费时费力效率低 。利用ABI遗传分析仪对荧光标记的DNA片段进行检测 ,结合分子量内标进行DNA片段长度计算 ,使STR分型变得高效快捷 ,结果也更加精确 。
STR鉴定实验流程
1 、实验方案的设计 ,包括荧光标记的选择 ,引物的设计 、合成和标记 、内标的选用等 。
2 、预实验 :确定PCR反应条件 。
3 、正式实验 :完成荧光PCR ,并在测序仪上完成电泳扫描 ,数据采集 ,去掉低值数据 ,分析结果 、补充测序 、完成分析 。
4 、对收集的数据进行处理分析 ,提供产物片段大小 、数量多少的信息数据 。
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